Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VEGFAP15692 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms