Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GP1BBP13224 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GP1BBP13224 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms