Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMP4P12644 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMP4P12644 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMP4P12644 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BMP4P12644 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP4P12644 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP4P12644 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BMP4P12644 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms