Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARBP10826 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARBP10826 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARBP10826 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARBP10826 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARBP10826 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RARBP10826 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARBP10826 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARBP10826 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RARBP10826 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARBP10826 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARBP10826 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARBP10826 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARBP10826 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RARBP10826 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RARBP10826 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARBP10826 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARBP10826 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARBP10826 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARBP10826 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARBP10826 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RARBP10826 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RARBP10826 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms