Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHGAP10645 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHGAP10645 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHGAP10645 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHGAP10645 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CHGAP10645 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHGAP10645 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CHGAP10645 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHGAP10645 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHGAP10645 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHGAP10645 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHGAP10645 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHGAP10645 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHGAP10645 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHGAP10645 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHGAP10645 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHGAP10645 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHGAP10645 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CHGAP10645 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHGAP10645 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHGAP10645 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHGAP10645 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHGAP10645 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHGAP10645 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CHGAP10645 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHGAP10645 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHGAP10645 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHGAP10645 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHGAP10645 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHGAP10645 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHGAP10645 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHGAP10645 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CHGAP10645 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHGAP10645 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHGAP10645 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHGAP10645 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHGAP10645 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHGAP10645 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHGAP10645 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHGAP10645 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHGAP10645 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CHGAP10645 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHGAP10645 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHGAP10645 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHGAP10645 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHGAP10645 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHGAP10645 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHGAP10645 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHGAP10645 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHGAP10645 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHGAP10645 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHGAP10645 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHGAP10645 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHGAP10645 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHGAP10645 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHGAP10645 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHGAP10645 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHGAP10645 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHGAP10645 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHGAP10645 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHGAP10645 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms