Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRFP10586 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms