Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMIGD3P0DMS9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms