Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms