Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00869P0C866 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms