Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOP08100 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOP08100 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOP08100 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHOP08100 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RHOP08100 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RHOP08100 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms