Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC3P02656 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms