Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNB1P01574 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNB1P01574 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNB1P01574 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNB1P01574 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNB1P01574 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNB1P01574 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNB1P01574 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNB1P01574 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNB1P01574 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms