Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GGPS1O95749 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms