Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FARP2O94887 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FARP2O94887 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP2O94887 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP2O94887 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP2O94887 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP2O94887 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP2O94887 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP2O94887 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FARP2O94887 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FARP2O94887 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP2O94887 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP2O94887 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP2O94887 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP2O94887 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP2O94887 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP2O94887 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP2O94887 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP2O94887 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP2O94887 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP2O94887 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP2O94887 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP2O94887 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP2O94887 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FARP2O94887 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP2O94887 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP2O94887 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP2O94887 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP2O94887 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP2O94887 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP2O94887 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP2O94887 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP2O94887 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP2O94887 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP2O94887 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP2O94887 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP2O94887 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP2O94887 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FARP2O94887 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP2O94887 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP2O94887 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP2O94887 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP2O94887 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP2O94887 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP2O94887 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP2O94887 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP2O94887 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP2O94887 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP2O94887 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP2O94887 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP2O94887 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FARP2O94887 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms