Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP9AO75110 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms