Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNT1O60563 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNT1O60563 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNT1O60563 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNT1O60563 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT1O60563 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT1O60563 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT1O60563 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT1O60563 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT1O60563 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT1O60563 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT1O60563 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT1O60563 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT1O60563 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT1O60563 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNT1O60563 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms