Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LANCL1O43813 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LANCL1O43813 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms