Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms