Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms