Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DYNC1LI2O43237 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1LI2O43237 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms