Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNMO15061 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNMO15061 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNMO15061 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNMO15061 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNMO15061 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNMO15061 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNMO15061 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNMO15061 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNMO15061 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNMO15061 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNMO15061 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNMO15061 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNMO15061 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNMO15061 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNMO15061 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNMO15061 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNMO15061 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNMO15061 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNMO15061 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNMO15061 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNMO15061 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNMO15061 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNMO15061 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNMO15061 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNMO15061 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNMO15061 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNMO15061 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNMO15061 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNMO15061 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNMO15061 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNMO15061 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNMO15061 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNMO15061 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNMO15061 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNMO15061 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNMO15061 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNMO15061 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNMO15061 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNMO15061 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNMO15061 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNMO15061 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNMO15061 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNMO15061 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNMO15061 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNMO15061 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNMO15061 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNMO15061 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNMO15061 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNMO15061 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNMO15061 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNMO15061 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNMO15061 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNMO15061 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNMO15061 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNMO15061 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNMO15061 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNMO15061 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNMO15061 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNMO15061 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms