Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEMA3EO15041 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms