Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SUPT5HO00267 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SUPT5HO00267 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SUPT5HO00267 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SUPT5HO00267 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SUPT5HO00267 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SUPT5HO00267 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SUPT5HO00267 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SUPT5HO00267 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SUPT5HO00267 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SUPT5HO00267 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SUPT5HO00267 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SUPT5HO00267 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SUPT5HO00267 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SUPT5HO00267 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SUPT5HO00267 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SUPT5HO00267 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SUPT5HO00267 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SUPT5HO00267 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SUPT5HO00267 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SUPT5HO00267 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SUPT5HO00267 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
SUPT5HO00267 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms