Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
A0A0U1RQF3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A0A0U1RQF3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms