Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 FAM135B-204ENST00000395297 6962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 RBFOX2-207ENST00000414461 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ABLIM1-206ENST00000392952 6841 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 OR10H3-201ENST00000305892 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC02090-201ENST00000419151 400 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC000362.1-201ENST00000433725 425 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL022721.1-201ENST00000436521 505 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 SSU72P8-201ENST00000473520 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC084361.1-201ENST00000537730 607 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC008734.1-201ENST00000594006 537 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 VDAC1P5-201ENST00000603132 844 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.146-201ENST00000619409 286 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 OR10H3-202ENST00000641646 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 TDP1-203ENST00000393454 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 MSANTD3-TMEFF1-201ENST00000502978 2069 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 CNDP1-203ENST00000582365 4111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 SMARCA1-202ENST00000371122 4099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 LINC02026-201ENST00000397645 1615 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ZNF174-203ENST00000571936 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 SELENOT-202ENST00000471696 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AP000542.3-201ENST00000623391 6114 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 EEF1A1P4-201ENST00000359165 1405 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 ZNF714-201ENST00000425625 2562 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 FAM177B-201ENST00000360827 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP141-201ENST00000364543 120 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SPOCK3Q9BQ16 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms