Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms