Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CCDC142Q17RM4 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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