Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PCM1Q15154 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 518 ms