Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MTCO1P55-201ENST00000489829 745 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 VDAC3-206ENST00000521158 949 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CSAG2-201ENST00000535353 237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 LINC01396-201ENST00000609099 527 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 TBX18-AS1-201ENST00000423086 421 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SMCO1Q147U7 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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