Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CUL4AQ13619 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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