Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD4Q12950 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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