Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 TMCC1-201ENST00000393238 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 ERG-210ENST00000442448 5034 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 EPHA1-AS1-202ENST00000429289 5018 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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