Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms