Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CDK8P49336 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CDK8P49336 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CDK8P49336 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CDK8P49336 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CDK8P49336 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms