Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 DHX32-202ENST00000368721 2389 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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