Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 CLEC1A-201ENST00000315330 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 UNC5C-201ENST00000453304 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 PAN2-201ENST00000257931 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 PAX6-236ENST00000638685 2372 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 PEX11A-201ENST00000300056 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 ZNF17-201ENST00000307658 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 MAP3K7CL-208ENST00000399935 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 CYTH4-201ENST00000248901 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 CES5A-204ENST00000520435 1948 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 HIST1H3G-201ENST00000614378 2411 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 NME9-202ENST00000333911 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 KRTAP8-3P-201ENST00000423658 188 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AC007683.1-201ENST00000432746 591 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AC091808.1-201ENST00000438867 786 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 RPL36P4-201ENST00000456725 318 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AP003119.1-201ENST00000533437 538 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AC002094.3-201ENST00000555059 851 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 MIR4274-201ENST00000579577 91 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 ZNF702P-210ENST00000600425 880 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AC135048.3-201ENST00000614997 328 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AC007603.2-201ENST00000623281 506 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AC245166.3-201ENST00000636897 257 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 ARFIP1-205ENST00000451320 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 NUP98-205ENST00000397007 3698 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 PDSS2-202ENST00000369037 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 TIMP2-204ENST00000586057 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 EXOC7-221ENST00000634349 2124 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AC005077.4-201ENST00000421546 3495 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 ITGB6-201ENST00000283249 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 EOMES-203ENST00000461503 2080 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 AC026336.3-201ENST00000611525 2076 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ATXN8OSP0DMR3 EFHC1-214ENST00000636107 3530 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 CAMSAP2-203ENST00000413307 4498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 KPNA5-201ENST00000356348 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 AC006213.1-202ENST00000589021 2176 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 GDNF-AS1-205ENST00000637926 3819 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 UQCRC2-201ENST00000268379 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 ADAM21P1-202ENST00000530196 2049 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 AC008758.1-201ENST00000428311 4505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 FAM107B-206ENST00000378470 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 THOC5-204ENST00000397873 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 OR51S1-201ENST00000322101 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 TMPRSS4-220ENST00000618855 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 RBBP9-201ENST00000337227 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 NCOA4-202ENST00000579039 2211 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 AL441943.2-201ENST00000421077 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 FGB-201ENST00000302068 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 PARP2-204ENST00000527915 1980 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 RNA5SP488-201ENST00000364942 116 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 PRRG3-202ENST00000370354 650 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 TDRKH-AS1-201ENST00000389897 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 TRAV18-201ENST00000390446 440 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 CCR3-203ENST00000395942 1201 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 HBA1-202ENST00000397797 504 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 MIR941-2-201ENST00000401322 72 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 MIR941-4-201ENST00000401376 72 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 AL512353.1-201ENST00000414798 514 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 LINC00694-201ENST00000416124 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 PIGCP2-201ENST00000433617 835 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 RPL7L1P2-201ENST00000446889 739 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 RPL4P2-201ENST00000447259 1282 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 AC073336.1-201ENST00000448767 664 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 UBE2F-SCLY-201ENST00000449191 951 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ATXN8OSP0DMR3 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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