Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC127024.1-201ENST00000490847 418 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC104211.2-201ENST00000521317 436 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 GSTM3-206ENST00000540225 678 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 IQCA1-206ENST00000431676 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 TRPM3-210ENST00000377111 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 LINC00299-201ENST00000430192 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 GSG1-203ENST00000396302 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 ATF2-203ENST00000392544 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 CCDC162P-214ENST00000640755 1958 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 TARS-201ENST00000265112 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 MS4A3-203ENST00000395032 867 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 AC006441.3-201ENST00000580121 456 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 CR392039.3-201ENST00000623236 227 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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