Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SNX15Q9NRS6 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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