Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL861P-201ENST00000473793 285 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC00964-204ENST00000528090 572 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC078929.1-201ENST00000547679 502 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 EIF4EBP2P2-201ENST00000563883 333 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL391807.1-201ENST00000603261 712 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PROX1-AS1-221ENST00000615085 673 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC241377.2-202ENST00000636462 997 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 Metazoa_SRP.212-201ENST00000636778 248 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AIFM1-205ENST00000460436 1925 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 GZMB-203ENST00000382542 666 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ATP5G1P5-201ENST00000429024 411 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RNF216-IT1-201ENST00000443837 337 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL233P-201ENST00000469988 277 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 HSD17B11-203ENST00000507286 851 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC012613.1-202ENST00000512647 424 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 SCARNA20.3-201ENST00000516913 131 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 IGLVI-70-201ENST00000523272 390 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC087280.1-201ENST00000530632 1003 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC007136.1-201ENST00000589141 199 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.7 ms