Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAPPC9Q96Q05 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.8 ms