Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 SCN10A-201ENST00000449082 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 TNC-202ENST00000350763 7641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PAICS-207ENST00000512576 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 EFHC1-201ENST00000371068 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 SCN5A-210ENST00000455624 7170 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 GPR161-210ENST00000546300 7388 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 NPM1P51-201ENST00000443470 744 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PRDM10-207ENST00000528746 6182 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.48
LAMA3Q16787 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
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