Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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TCIRG1Q13488 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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TCIRG1Q13488 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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TCIRG1Q13488 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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TCIRG1Q13488 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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TCIRG1Q13488 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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