Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC022639.1-204ENST00000520365 569 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LINC00964-204ENST00000528090 572 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXE3Q13461 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms