Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 NCKAP5-201ENST00000317721 7593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 NCKAP5-205ENST00000409261 7594 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 THADA-206ENST00000405006 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BPTFQ12830 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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