Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC092718.2-201ENST00000562315 487 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC019294.2-201ENST00000565686 553 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 SNRPD2-208ENST00000590212 454 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AL137002.1-201ENST00000600642 182 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 FANCM-202ENST00000542564 6167 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 ANKRD13C-202ENST00000370944 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 GIT2-205ENST00000457474 5291 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 COL6A4P1-201ENST00000446690 2336 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 SLC4A4-205ENST00000512686 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 GPR161-210ENST00000546300 7388 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 GUCY1B3-203ENST00000503520 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC005154.1-215ENST00000584621 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 LRRC37A3-211ENST00000584306 5665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 FAM172A-201ENST00000395965 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 ATP7B-205ENST00000418097 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 ALG9-210ENST00000531154 1930 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 FAT4-201ENST00000335110 9669 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 ISX-202ENST00000404699 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 PUS7L-202ENST00000416848 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 LINC01120-201ENST00000437751 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 CLTCL1-211ENST00000621271 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 OR10H4-201ENST00000322107 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 OR51I2-201ENST00000341449 1070 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 TRAV18-201ENST00000390446 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 GPRC5D-202ENST00000396333 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 RNA5SP158-201ENST00000410298 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 CYP4F62P-201ENST00000417310 524 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC090044.1-201ENST00000423193 497 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC010982.1-201ENST00000450325 465 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 PGAM4-201ENST00000458128 765 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 RN7SL865P-201ENST00000466711 289 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC063980.1-201ENST00000514282 414 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 MBP-228ENST00000527041 582 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 KCTD21-AS1-204ENST00000528468 554 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AP003031.1-201ENST00000534354 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC008770.2-201ENST00000547473 542 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 LINC01405-204ENST00000553177 524 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC009119.3-201ENST00000562835 388 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 HLF-208ENST00000573945 2977 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 CYP2A7P2-201ENST00000600605 641 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC005291.2-201ENST00000609088 523 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 STYK1-201ENST00000075503 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 FAM161B-201ENST00000286544 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 SLC17A6-201ENST00000263160 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 EXT2-203ENST00000395673 3454 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 PIBF1-201ENST00000326291 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 BBS4-201ENST00000268057 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 C2orf49-201ENST00000258457 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 SH3GLB1-203ENST00000535010 6227 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 ALDH2-201ENST00000261733 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 SRP19-204ENST00000505459 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC003958.2-202ENST00000432258 3890 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 PPP1R12A-213ENST00000550107 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 FTSJ3-201ENST00000427159 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AL117192.1-202ENST00000557689 1990 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 MROH5-201ENST00000430863 4164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC005176.1-201ENST00000594263 1831 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 SLC38A4-202ENST00000447411 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 C5orf22-201ENST00000325366 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 KANSL3-206ENST00000431828 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 IGBP1-202ENST00000356413 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 LINC01838-201ENST00000595783 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 CASK-208ENST00000442742 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms