Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ACTBP60709 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ACTBP60709 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ACTBP60709 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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