Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SIRPB2-201ENST00000359801 2642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 NTRK3-208ENST00000557856 2622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 NRAP-204ENST00000369360 5535 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 COX15-202ENST00000370483 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ZNF587-202ENST00000419854 5731 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LINC02288-201ENST00000500215 2924 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TXNL1-201ENST00000217515 6894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LIN28A-201ENST00000254231 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PNMA8A-201ENST00000313683 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CLUHP3-201ENST00000254109 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TRPV3-201ENST00000301365 3235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 DIS3L-202ENST00000319212 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 IDH1-201ENST00000345146 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 DDR2-201ENST00000367921 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PRKG2-202ENST00000395578 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ATN1-202ENST00000396684 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 GSG1-204ENST00000432710 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RPSAP17-201ENST00000437336 883 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 FTH1P7-201ENST00000450676 552 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SSU72P8-201ENST00000473520 585 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LINC00994-201ENST00000485805 2129 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TP53-213ENST00000510385 2404 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SRD5A3-AS1-202ENST00000510637 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC096996.2-201ENST00000563906 426 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 FRG2KP-201ENST00000565692 971 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC138907.1-201ENST00000570183 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ZNF506-207ENST00000587461 831 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ARMCX7P-202ENST00000602449 655 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC026468.1-201ENST00000614981 107 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TP53-223ENST00000618944 2404 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 UBR4-201ENST00000375218 4031 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SP100-201ENST00000264052 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 COL10A1-201ENST00000243222 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 FAM98B-203ENST00000491535 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ZNF8-201ENST00000621650 9128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SPDL1-201ENST00000265295 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 GOLGA8EP-202ENST00000620011 5241 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ZNF30-201ENST00000303586 2579 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MELK-201ENST00000298048 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ABCC8-202ENST00000389817 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 GREB1-202ENST00000263834 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SEC61A2-204ENST00000379020 2252 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 WDR93-205ENST00000560294 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SLC22A24-203ENST00000612278 2101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 GBA-203ENST00000427500 2063 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 OR6M2P-202ENST00000641780 2063 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LDAH-202ENST00000381090 2045 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC005035.1-201ENST00000627215 3727 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL512506.3-201ENST00000627615 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 HMBOX1-201ENST00000287701 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SERPINA3-202ENST00000393080 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RAB3IP-215ENST00000551641 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PACRG-202ENST00000366888 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PDYN-202ENST00000539905 2725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MYO7B-203ENST00000428314 6715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ACVR2B-201ENST00000352511 11821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 OXNAD1-201ENST00000285083 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CSTL1-202ENST00000347397 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 GPRC5D-202ENST00000396333 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC064847.1-201ENST00000403125 506 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL353692.1-201ENST00000405081 755 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms