Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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USP18Q9UMW8 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
USP18Q9UMW8 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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