Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
ZNF56Q15929 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ZNF56Q15929 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms