Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms